Do khu vực châu Phi được FIFA phân bổ 9 suất trực tiếp tham dự vòng chung kết thay vì 5 suất như trước đây, Ủy ban điều hành Liên đoàn bóng đá châu Phi đã công bố thể thức mới của vòng loại vào ngày 19 tháng 5 năm 2023 như sau:

• Vòng 1: 54 đội tuyển thuộc khu vực châu Phi sẽ được chia thành 9 bảng 6 đội, thi đấu vòng tròn hai lượt sân nhà và sân khách. 9 đội đứng nhất bảng sẽ có suất trực tiếp tham dự World Cup 2026, 4 đội đứng nhì bảng có thành tích xuất sắc nhất sẽ tham dự vòng play-off.
• Vòng 2: 4 đội tuyển sẽ được chia thành 2 cặp đấu, đội thắng ở mỗi cặp đấu sẽ đối đầu trực tiếp với nhau để chọn ra đội giành suất tham dự vòng play-off liên lục địa.